K dobré teorii: COVID-19. Analýza vývoje/27
Do seriálu o dobré teorii zařazuji "retro" – připomenutí toho, jak jsem společně s kolegy, s nimiž dlouhodobě spolupracuji, i s těmi, se kterými jsem postupně navázal kontakt, analyzoval aktuální vývoj. Sleduji tím dvojí:
- Ukázat, jak je důležitý interdisciplinární přístup a týmová práce, tj. že dobrá teorie hodně dokáže. (To si každý může ověřit porovnání toho, co jsme říkali před měsícem s tím, co se odehrává nyní.)
- Trochu oživit krátkodobou paměť, protože někteří zapomínají až příliš rychle.
V tomto pokračování uveřejňuji velmi důležitý (ne-li klíčový) článek J. Flegra o superparazitaci. Dosud není potvrzeno, zda se jedná o fenomén, který rozhoduje o průběhu epidemie, ale mně se to zdá velmi pravděpodobné. Zajímavé jsou i "vybočení" počtu úmrtí oproti tříletému průměru dle stránek o koronaviru uveřejňovaných prostřednictvím Financial Times. Zapouzdřeným popíračům ovšem ani toto nestačí.
COVI-kávička k 3.5.: 26 nových případů. Komentář
4. květen 2020
Zdroj: https://radimvalencik.pise.cz/7817-covi-kavicka-k-3-5-26-novych-pripadu-komentar.html
26 (+8 oproti předcházejícímu dnu) nových případů za 3. 5. Lze číst i jako potvrzení velmi příznivého trendu.
Významný je i pokles počtu hospitalizovaných ke dni 2.5. na 308 (-11) oproti předcházejícímu dni, což je rovněž uklidňující výsledek a dobrá zpráva z hlediska vývoje struktury podkmenů COVID-19.
Jak to vidím
Flegr o superparazitaci
Uveřejňuji celý vynikající text evolučního biologa a parazitologa ovládajícího skvěle teorii evolučních her profesora Jaroslava Flegra k fenoménu "superparazitace". Je určen každému, kdo si ještě uchoval schopnost myslet alespoň na úrovni Micíka, což je Flegrův kocourek. Vychutnejte si ho (ten text, ne toho kocourka) a dejte ho přečíst i svým známým:
Micíku, Micíku. Kolikrát ti mám říkat, že nemáš nosit domů rejsky a vůbec už je nemáš pouštět živé za botník. Aby sis to konečně zapamatoval, tak ti dnes povím, co je to superparazitace a proč bychom si na ni měli dát nyní velký pozor.
Superparazitace je nákaza již nakaženého jedince. V jeho těle se následně množí dva odlišné kmeny parazita, třeba viru. To bývá malér. Při jednoduché infekci si musí parazit svého hostitele šetřit. Jestliže by se v něm množil příliš rychle, hostitel by mu dříve umřel a on by tak nakazil málo nových hostitelů (měl by nízké reprodukční číslo). Při superinfekcí se pravidla mění – paraziti jako by si řekli: proč se množit pomalu, když mi hostitele stejně zabije jiný, méně šetrný kmen parazita. Jestliže v prostředí dochází k častým superinfekcím, tedy když jsou paraziti v prostředí velmi hojní, a zejména když v něm koluje mnoho geneticky odlišných variant parazita, začnou postupně vyhrávat ty z nich, které se v hostiteli množí maximální rychlostí. Takoví paraziti svému hostiteli nejvíce ubližují, tedy mají nejvyšší virulenci.
Jestliže je například v zemi A je 5x větší riziko infekce než v zemi B, je tam automaticky i 25x větší riziko superinfekce. To znamená, že v zemi se nejen nakazí 5x více koček, ale nakazí se mnohem virulentnějšími kmeny parazita a mají tak mnohem větší riziko, že zemřou. S rozvolňováním epidemiologických opatření rychle stoupá počet nakažených; ještě rychleji však stoupa počet mrtvých. To, že u nás zatím umírá mnohem méně nakažených koronavirem než v jiných zemích, není dáno jen kvalitou našeho zdravotnictví a naší větší odolností v důsledku očkování proti tuberkulóze. Je to dáno i tím, že v důsledku účinných epidemiologických opatření tu máme zatím málo superinfekcí, a tudíž nám zde kolují "hodnější" varianty viru. Když by ses, Micíku, chtěl nakazit opravdu zlým parazitem, tak bys měl zajet do země, kde epidemii nezvládli, kde jsou povoleny akce pro mnoho koček, kde kočky chodí dál do školy, nemusí nosit na veřejnosti roušky a podobně. Moc dobré bude, když v zemi nebude omezeno cestování, takže se tam budou moci potkávat nakažené kočky i ze vzdálených oblastí. V takové zemi bude nejen mnohem více infekcí, ale zejména mnohem více superinfekcí a mnohem více mrtvých.
Hmm, ale ty se asi nakazit zlým parazitem nechceš, co? Ty si chceš ještě hodně dlouho lovit rejsky a užívat si drbání na bradičce. To ti schvaluji. Teda až na ty rejsky!
Viz: https://www.facebook.com/jflegr
Vynikající stránky k epidemii COVID-19 jsou tyto:
https://www.facebook.com/groups/208008770285228/
Najdete na nich původní rozbory, shrnující informace, zajímavé diskuse, dílčí příspěvky. Stránka vznikla "zdola", z iniciativy lidí různé odbornosti, kteří se na ní postupně sešli. Člověk si musí umět vybrat, ale nikde jinde nenajde tak všestranný zdroj informací. Doufám, že se někdy brzy dostanu k tomu, abych udělal průvodce těmito stránkami.
Co se děje ve světě:
Graf šíření mutuací
https://nextstrain.org/ncov/global?gmax=19896&gmin=15114
Zde je nejlepší zdroj s nejčerstvějšími informacemi:
https://www.worldometers.info/coronavirus/#countries
Další vynikající graf, na který odkazuje a ze kterého přebírá i Financial Times je zde:
https://www.ft.com/coronavirus-latest
Jsou v něm kromě jiného názorně vyjádřeny i posuny v úmrtnosti oproti předcházejícímu tříletému průměru v jednotlivých zemích. "Štíty" a "hory" by snad mohly přesvědčit i zatvrzelé popírače a chřipkaře o tom, že epidemie není žádná legrace.
A tady si můžete vybrat, kam jet na dovolenou. Z grafu je mj. vidět, že v Chorvatsku se to teprve rozjíždí a že Německo na tom vůbec není moc dobře:
Podrobněji lze vývoj v ČR sledovat zde:
Nejdůležitější je tento graf:
Na závěr: Děkuji všem, kteří mi zasláním materiálů a doporučeními pomáhají. Rád uvedu jména, pokud dají souhlas.