K dobré teorii: COVID-19. Analýza vývoje/33
Do seriálu o dobré teorii zařazuji "retro" – připomenutí toho, jak jsem společně s kolegy, s nimiž dlouhodobě spolupracuji, i s těmi, se kterými jsem postupně navázal kontakt, analyzoval aktuální vývoj. Sleduji tím dvojí:
- Ukázat, jak je důležitý interdisciplinární přístup a týmová práce, tj. že dobrá teorie hodně dokáže. (To si každý může ověřit porovnání toho, co jsme říkali před měsícem s tím, co se odehrává nyní.)
- Trochu oživit krátkodobou paměť, protože někteří zapomínají až příliš rychle.
V tomto pokračování uveřejňuji Flegrovu úvahu o významu zbytkového množství viru pro fungování imunitního systému. Důležité, protože to je patrně klíčem k pochopení vývoje nákazy a odpovědí na otázku, k jakému typu evolučně stabilní strategie virus směřuje. Doprovozeno pohádkou vlastní výroby. Ladí s předešlým právě tak jako poznámka k infekční dávce - rozhoduje nikoli velikost, ale složení, tj. zda obsahu agresivní portfolio mutací, z nichž každá sama o sobě je neškodná.
COVI-kávička k 9.5.: 18 nových případů. Komentář
10. květen 2020
18 (-28 oproti předcházejícímu dnu) nových případů za 9. 5. Podle očekávání velmi nízké hodnoty. Ovlivněno malým počtem testů.
Významný je i další pokles počtu hospitalizovaných ke dni 8. 5. na 251 (-7) oproti předcházejícímu dni, což se stává dlouhodobým trendem.
Jak to vidím
Nové k mutování viru:
Konečně se o mutování viru začíná hovořit víc a víc. Například zde v souvislosti s vakcínou:
https://www.novinky.cz/koronavirus/clanek/virus-mutuje-nemusi-to-znamenat-katastrofu-40323418
Ale nic zvlášť objevného.
Důležitým zdrojem je "Velký manuál", který vydaly Lidovky. Obsahuje dobře uspořádané velké množství informací. Určitým novým prvkem je zde spekulace o významu velikosti dávky, která člověka nakazila, viz:
Význam infekční dávky pro průběh epidemie
Veškerá dosavadní pozorování svědčí o tom, že šíření infekce SARS CoV2 v populaci může probíhat velmi mírně, pod obrazem necharakteristické virózy nebo zcela asymptomaticky. Takto virus infiltroval alpská lyžařská střediska v průběhu února. Při dovolené na horách, kde se soustřeďovali zdraví lidé, kteří navíc trávili většinu dne venku na čerstvém vzduchu, nebyly podmínky pro vznik infekčního aerosolu a nevznikala závažná onemocnění.
Zcela jinak se chovala infekce v lokalitách s velkým nahloučením obyvatel, přičemž se jako další přídatný faktor mohl uplatňovat pobyt ve špatně větraných veřejných prostorech (sportovní haly, nákupní střediska, metro apod.). Za této situace může dojít k vysoké koncentraci virů ve vzduchu a to vytváří podmínky pro postižení dolních dýchacích cest a plic. Nemocní jedinci svým kašlem přispívají ke stále rychlejšímu šíření nákazy a současně i závažnějšímu průběhu infekce. Teprve v této fázi začínají nejvíce nemocní lidé vyhledávat lékařskou pomoc. Mezitím se již počet postižených rychle rozrůstá a rozvíjí se spirála vedoucí k explozivní epidemii.
Patrně to však bude jinak. Nejde o velikost, ale o složení dávky z hlediska přítomnosti různých mutací, tj. z hlediska tzv. superparazitsmu. O tom podrobněji pozítří (musím udělat podrobnější analýzu).
Rouškatá pohádka: O sněmu koronavirů
Další Flegrovku uvedou následující pohádkou:
Předevčírem jsme byli na návštěvě o blízkých známých, kteří bydlí nedaleko. Příjemný večer. Mají vnoučka, chodí do druhé třídy. Navrhl, abychom ztlumili světlo a vyprávěli si příběhy. Když jsme zapálili svíčku a zhasli, začal jako první. Bylo to na motivy Star Wars. Boj dobra (lidí) se zlem (koronavirus). Bylo vidět, že ho téma velmi trápí. Pak mě vyzval, abych vyprávěl svůj příběh. Tak jsem začal. Momentální nápad. Věděl jsem, co chci říci, příběh jsem musel v průběhu vyprávěné domýšlet
Sešel se Velký sněm koronavirů. Byli tam zástupci ze všech zemí světa. Jako první se k řečnickému pultu prodral tak velký koronavirus, že ostatní vůči němu vypadali jako trpaslíci. Jeho výčnělky, kterým se říká viriony, byly ostré jako hroty kopí a mezi nimi přeskakovaly jiskry, když hřímal: "Musíme vyhubit člověka. Každého. Do posledního! Nelítostně a nemilosrdně."
Přeplněný sál zabouřil potleskem. Mezi tím se k řečnickému pultu nenápadně dostal mnohem menší koronavirus. Starší a mnohem menší. Lipidový plášť měl odraný, viriony obroušené, některé ulomené. Začali ho poslouchat jen ze zvědavosti či slušnosti, především proto, že všechny překvapil jeho zvonivý, kupodivu velmi mladý hlas: "Naším hlavním úkolem, když jsme byli vyhnáni z Ráje, nebylo zabíjet, ale žít. Někdy je potřeba zabíjet, abychom žili, ale když zabijeme všechny lidi, zahyneme též. Bez nich žít nedokážeme."
Na chvíli se odmlčel. V sále se ozval slabý, rozpačitý potlesk.
"Naštěstí člověka nepotřebujeme zabít, abychom mohli žít a přežít. Proto je lépe naučit se s ním žít. Tak aby o nás ani nevěděl. Jen tak si náš kmen zajistí budoucnost. Když člověku škodíme, ohrožujeme sami sebe..."
Velký koronavirus ho odstrčil a mocným hlasem oslovil přítomné: "Takové poraženecké, zrádcovské a kolaborantské řeči přece nebudeme poslouchat! Byli jsme stvořeni a z Ráje vysláni, abychom vyhubili lidskou rasu!" Udělal dramatickou pauzu v očekávání potlesku. Ale sál jen zašuměl. Začal se ozývat pískot.
"Se zrádci tu nebudu!", hrozivě zvolal velký virus a vyzval všechny přítomné, aby šli dokončit velké dílo. Odešla s ním však jen jeho družina, ke které se přidalo několik dalších jedinců. Velká většina v sále zůstala a svým napjatým mlčením vyzvala menšího koronavira, aby pokračoval:
"Naším nepřítelem není člověk, ale ti, kteří nás chtějí připravit o jediné místo k životu, pro které jsme stvořeni. Musíme se učit člověku neškodit. Nebude to jednoduché, ale naučíme se to. A také každé člověčí buňce, kterou potkáme a ve které je kousek lidského rozumu, vysvětlovat, že se člověk musí co nejvíce bránit proti těm našim soukmenovcům, kteří ho chtějí zabít. Naše trpělivost je naší největší zbraní. Čím více se člověk bude bránit, bude dodržovat karanténu, omezí množství kontaktů, tím dříve porazí ty naše soukmenovce, kteří mu chtějí ublížit. My musíme využít své nenápadnosti a obsadit místo k životu. Tak jak se to naučila spousta organismů dávno před námi, kteří také nejdříve nejen člověka, ale i jeho předchůdce zabíjeli, aby pak, až zmoudřeli, po milióny let žili společně s nimi." – Skončil jsem vyprávění pohádky.
"A jak to dopadlo?" – Zeptal se mě vnouček.
"Jak to dopadne?" – Opravil jsem ho otázkou. "Dobře. Příroda je moudrá a pomůže těm moudřejším."
A to už je pohádky konec. Prý ji vnouček vyprávěl i svým kamarádům, jen jí dal ještě lepší, "starwarsové" balení.
Profesor Flegr o tom, co nás čeká:
Další skvělá Flegrovka. Doufám, že jednou vyjde jako knížečka s harmonogramem událostí:
Milý Micíku, ještě o tom možná nevíš, ale určitě se chceš dozvědět, co je to nesterilní imunita. Ono je to totiž právě nyní docela důležité. Tak hezky zavři očička a poslouchej. Souhlasné vrnění vítáno.
S parazity včetně virů bojují bílé krvinky. Ty dokážou rozpoznat přítomnost vetřelců, odhadnout jejich nebezpečnost a v případě nutnosti je i zlikvidovat. Boj s vetřelci je však dosti nákladný a často při něm vznikají vedlejší škody – například poškození našich orgánů v důsledku zánětů. Aby byly škody co nejmenší a abychom na boj zbytečně neplýtvali energií, nesnaží se náš imunitní systém vetřelce zlikvidovat "do posledního muže". Když už je bitva rozhodnuta, uzavře s ním často jakési příměří a dovolí mu v těle v malém množství přežívat dlouhodobě, mnohdy i doživotně. Kromě toho, že tak šetří síly na další zápasy, má k tomu i další, velmi důležitý důvod. Součástí imunitního systému jsou i paměťové buňky, které nám umožňují podstatně rychleji rozpoznat a zlikvidovat vetřelce, když se s ním setkáme podruhé. Tato imunologická paměť (získaná imunita), však není doživotní a s časem postupně mizí. Proto se také musíme v určitých intervalech nechávat přeočkovat. V případě, že náš systém nevyhubí parazita úplně a dovolí mu v malém množství, a třeba jen v určitých tkáních přežívat, jsou jím naše bílé krvinky stimulovány trvale, a také naše imunita vůči němu je trvalá. Hovoříme o tzv. nesterilní imunitě.
A nyní se dostáváme k současné epidemii. Není vůbec pravděpodobné, že by se pacienti s COVID-19 zbavili viru úplně. Daleko spíše se u nich navodí pouze nesterilní imunita – nebudou nemocní, ale virus v jejich tělech bude přetrvávat a asi budou přinejmenším občas i mírně infekční. Jenže budou produkovat jen velmi malé množství viru, takže většina osob, které infikují, nákazu zlikviduje hned v zárodku. Vyléčení lidé tak budou postupně přispívat k šetrnému promořování naší populace. Takto získaná imunita nejspíš nebude dokonalá. Budoucí nákaze velkým inokulem nejspíš nezabrání, ale určitě výrazně přispěje ke zmírnění průběhu onemocnění. Lidská populace je promořena čtyřmi hlavními typy koronavirů a nijak zvlášť moc nám to nevadí. Víc než 70 % z nás v sobě dokonce nese zástupce všech čtyř typů. Je pravděpodobné, že naše děti se nyní postupně promoří ve školkách a školách, takže v příští generaci už těchto typů bude pět. Bohužel promořování dnešní dospělé populace a dosažení nesterilní imunity nebude bezbolestné. Měli bychom se proto pomocí dodržování epidemiologických opatření snažit, aby u nás co nejdříve převládly hodné mutanty koronaviru, aby se co nejvíce lidí nakazilo pouze z jednoho zdroje a aby bylo tak co nejméně superinfekcí. Lepší bude se nakazit od někoho, kdo už dosáhl nesterilní imunity než od někoho, kdo právě prodělává první těžké fáze onemocnění. Také je důležité, aby infekční dávka byla u většiny osob co nejmenší – takže pokud možno nosit roušky a často si umývat ruce. A měli bychom si s nákazou většiny populace počkat co nejdéle, nejlépe až do doby, kdy klesne virulence kolujících virů a kdy budou k dispozici vhodné léky. Remdesivir podle čerstvých závěrů studie účinkuje, ale stále to ještě není žádná velká sláva.
Tak Micíku a běž si hrát do kuchyně. Ven nechoď, prší a já nechci mít zase tlapičkový vzor na ubruse.
Případně se mrkni na pokusnikralici.cz
https://www.facebook.com/jflegr/posts/10215986339999171
Vynikající stránky k epidemii COVID-19 jsou tyto:
https://www.facebook.com/groups/208008770285228/
Najdete na nich původní rozbory, shrnující informace, zajímavé diskuse, dílčí příspěvky. Stránka vznikla "zdola", z iniciativy lidí různé odbornosti, kteří se na ní postupně sešli. Člověk si musí umět vybrat, ale nikde jinde nenajde tak všestranný zdroj informací. Doufám, že se někdy brzy dostanu k tomu, abych udělal průvodce těmito stránkami.
Co se děje ve světě:
Graf šíření mutuací
https://nextstrain.org/ncov/global?gmax=19896&gmin=15114
Zde je nejlepší zdroj s nejčerstvějšími informacemi:
https://www.worldometers.info/coronavirus/#countries
Podrobněji lze vývoj v ČR sledovat zde:
Nejdůležitější je tento graf:
Na závěr: Děkuji všem, kteří mi zasláním materiálů a doporučeními pomáhají. Rád uvedu jména, pokud dají souhlas.
Zdroj: https://radimvalencik.pise.cz/7835-covi-kavicka-k-9-5-18-novych-pripadu-komentar.html