K dobré teorii: COVID-19. Analýza vývoje/40

15. 06 2020 | 01.00

V tomto pokračování formuluji důležitou alternativu: Rodí se nová strategie používaná našim virem až s další mutací, nebo se může nás virus během svého života "přepnot" z jedné strategie na druhou? (Tj. "zdivočet", nebo se "ochočit".)

Do seriálu o dobré teorii zařazuji "retro" – připomenutí toho, jak jsem společně s kolegy, s nimiž dlouhodobě spolupracuji, i s těmi, se kterými jsem postupně navázal kontakt, analyzoval aktuální vývoj. Sleduji tím dvojí:

- Ukázat, jak je důležitý interdisciplinární přístup a týmová práce, tj. že dobrá teorie hodně dokáže. (To si každý může ověřit porovnání toho, co jsme říkali před měsícem s tím, co se odehrává nyní.)

- Trochu oživit krátkodobou paměť, protože někteří zapomínají až příliš rychle.

COVI-kávička 15.5: 82 nových případů. Komentář

 

15. květen 2020
Zdroj: https://radimvalencik.pise.cz/7867-covi-kavicka-15-5-82-novych-pripadu-komentar.html

82 (+18 oproti předcházejícímu dnu) nových případů za 14. 5. Určit nárůst, ale patrně to bude větším počtem provedených testů (ten se zveřejňuje s denním zpožděním) a běžný výkyv spojený s nějakým novým zdrojem nákazy.

Významný je další pokles počtu hospitalizovaných ke dni 13. 5. na 230 (-17) oproti předcházejícímu dni. To nelze vysvětlit jen účinnější léčbou, ale začíná působit Flegrův efekt prosazování méně agresivních forem. O tom bude pojednáno podrobněji zítra.

Jak to vidím

Drobnosti:

Čím víc mluvíte..., tím snadněji se nakazíte. Ještě k přenosu koronaviru a významu roušek:

https://www.novinky.cz/koronavirus/clanek/proc-je-sars-cov-2-tak-nakazlivy-koncentruje-se-ve-slinach-a-prenasi-se-tak-mluvenim-40324063?fbclid=IwAR3p58ta3KCZsUdXKQnfSnNkqaHFjAOlwrtnnW2MgQprgERawKYbePSasCk

"Druhá vlna", "kolektivní imunita" apod. - v případě COVID-19 mimo mísu. Toto jsou matoucí články:

https://www.novinky.cz/koronavirus/clanek/ceka-nas-temna-zima-tvrdi-imunologove-druha-vlna-koronaviru-se-potka-s-dalsimi-infekcemi-40324130?fbclid=IwAR0bBTLI2SmNYcmvVehuAlBkjdqoRLtrw94faz1ZoeDnaYtAFhY4uqgBJEE

Standardní podpásovka. Součást hry o Německo, které má dnes klíčovou roli (aniž si to samo uvědomuje):

https://www.novinky.cz/koronavirus/clanek/opatreni-pozabijela-vic-lidi-nez-virus-sam-tvrdi-nemecka-analyza-40324118?fbclid=IwAR1exc80S7yJPNJqoqQD9H3IrZf_-QE_W0f5OcaLBbDs_-7N94Ak-TquQHw

Od kolegy Tomáše Kosičky jsem dostal toto důležité doplnění k včera uveřejněnému článkuo teorii evolučních her:

Nevím, jestli může převládnout kooperativní strategie, v opakovaném PD v takovém případě vítězí strategie Kingpin. Kingpin je "mafiánská" strategie, stejná mutace spolu kooperuje, s ostatními zrazuje. Ale i kdyby převládla (nebo možná právě když převládne), tak bude k hostiteli brutální.

Moje představa je následující:

Pokud máme v těle více mutací jednoho viru, potom tyto mutace bojují o své místo na slunci hlavně proti sobě. U normálního člověka (průměrně zdravý, se slušnou imunitou atd.) se k tomu přidá ještě boj proti jeho slušné imunitě a tak ty slabší mutace prohrají, nedostatečně se rozmnoží a dále se boje neúčastní. Proti té jedné mutaci celkem rychle tělo najde obranu a dojde k obnovení rovnováhy a člověk nemá vnější projevy choroby.Naopak u slabších kusů (choroby, snížená imunita atd.) mutace proti sobě bojovat nemusí, protože se "nažerou" všichni, tělo vlastně pořádně neví s kým konkrétně bojovat, zahltí se a dojde ke kolapsu.

K ověření této teorie by ovšem bylo potřeba důkladné zkoumání, jestli vůbec někdo vykazuje více (mikro)mutací než jednu. Ale jako hypotéza se to použít dá.

Taky bych považoval za rozumné k tomu doplnit model vzniku a šíření mutací (což kupodivu snad nikdo pořádně nedělá). Stačily by dvě diferenciální rovnice, které se klidně dají opsat z mé disertačky.

K tomu:

Jak už jsem napsal, pokud jde o vývoj mutací koronaviru z hlediska patogenity a virulence, pak je nejdůležitější následující alternativa:

A: Změna chování viru je umožněna jen mutacemi a následným působením přirozeného výběru, tj. tím, že přežívají jen jedinci, kteří jsou v daných podmínkách na přežití nejlépe vybavení. Tj. sám jedinec nemůže měnit své chování.

B: Ke změně chování viru může dojít i během jeho života, a to v podobě jeho reakce na prostředí, ve kterém se nachází. Virus je schopen měnit strategie, dokonce je schopen ostatním virů vysílat signály, jakou strategii zvolil, a sám přijímat odvetné reakce.

Podrobněji zítra.

Vynikající stránky k epidemii COVID-19 jsou tyto:

https://www.facebook.com/groups/208008770285228/

Najdete na nich původní rozbory, shrnující informace, zajímavé diskuse, dílčí příspěvky. Stránka vznikla "zdola", z iniciativy lidí různé odbornosti, kteří se na ní postupně sešli. Člověk si musí umět vybrat, ale nikde jinde nenajde tak všestranný zdroj informací. Doufám, že se někdy brzy dostanu k tomu, abych udělal průvodce těmito stránkami.

Co se děje ve světě:

Zde je nejlepší zdroj s nejčerstvějšími informacemi:

https://www.worldometers.info/coronavirus/#countries

Další významné zdroje o dění ve světě:

https://www.ft.com/content/a26fbf7e-48f8-11ea-aeb3-955839e06441

https://ourworldindata.org/coronavirus

První z odkazů přebírá Financial Times. Je na něm mj. vyjádřeno i to, jak vzrostl počet úmrtí v jednotlivých zemích oproti tříletému průměru. Na to by se měli podívat všichni popírači a chřipkaři.

Graf šíření mutuací

https://nextstrain.org/ncov/global?gmax=19896&gmin=15114

Podrobněji lze vývoj v ČR sledovat zde:

https://onemocneni-aktualne.mzcr.cz/covid-19?fbclid=IwAR3kdxZhYD7krsZ_K-xrmwNkGlQMO5rsIjQe_0jAWZT___jH_9pV_KzA38c

Nejdůležitější je tento graf:

Na závěr: Děkuji všem, kteří mi zasláním materiálů a doporučeními pomáhají. Rád uvedu jména, pokud dají souhlas.