COVI-kávička 24.7.: ČR +235 US +69116. Komentář

24. 07 2020 | 07.23

Česká republika: +235 nových případů, to je zase víc než dost, velmi nepříjemné

Spojené státy:    +69116 nových případů (jen o necelé tři tisíce méně než předcházející den), stále dramaticky vysoké hodnoty

I další země mají velké problémy, viz dále.

Pokud srovnáváme jednotlivé země mezi sebou, je nutné uvažovat různou metodiku a další faktory, které výsledek ovlivňují (např. počet testů). K tomu se postupně dostanu. Důležité je však právě průběžně sledování, protože z časových řad lze vyčíst hodně i při odlišných metodikách.

Informace čerpám zejména z: https://www.worldometers.info/coronavirus/#countries

Jak to vidím

Očekávání a realita: Proč se všichni mýlili?

Všichni očekávali, že přijde tzv. druhá vlna, někdy na podzim a trochu menší.

Realita? Po menší etapě zpomalení šíření epidemie postupná obnova síly první vlny v důsledku jejího nezvládnutí a tudíž i exponenciálního růstu nákazy, viz:

 

Co je příčinou? Lze uvažovat tři alternativy šíření našeho viru:

- Standardní průběh nákazy. – To však neodpovídá očekávané realitě.

- Vznik agresivnějších mutací. – Zatím nic takového nedoloženo.

- Agresivní chování propukne jen tam, kde dojde k vícenákazám (soupeří více velmi blízkých mutací) – Zkusme se na to podívat prostředky, které máme k dispozici.

Ze všech možností mně jako jediná, která odpovídá realitě, připadne ta třetí alternativa. Uvidíme a možná brzy.

Situace ve světě hodně špatná:

 

U nás se situace trochu (dost) dramatizuje:

"Nárůst nakažených a celkově nejvíce covid pozitivních osob od začátku vypuknutí pandemie v Česku znamená, že budeme některými zeměmi vyškrtnuti ze seznamu bezpečných zemí. Jako první státy o tom podle ministra zahraničí Tomáše Petříčka (ČSSD) uvažují Lotyšsko a Estonsko. Při cestě tam budete muset zřejmě strávit 14 dnů v karanténě."

Viz: https://www.novinky.cz/domaci/clanek/prvni-staty-zvazuji-ze-vyradi-cesko-ze-seznamu-bezpecnych-zemi-40331426

"Ministr zdravotnictví Adam Vojtěch (za ANO) oznámil, že od soboty 25. července bude povinné nosit roušky na vnitřních hromadných akcích nad sto osob. Od pondělí bude omezena kapacita těchto akcí na 500 osob."

Viz: https://www.novinky.cz/koronavirus/clanek/jak-se-nosily-rousky-v-cesku-vojtech-oznamil-nova-plosna-opatreni-40331451

Analýza poznatků o průběhu epidemie v návaznosti na přijatá opatření 8. část

Zkrácená verze výborné analýzy nazvané "Koronavirus: Měli bychom se zaměřit na stádní imunitu jako Švédsko? A co se mohou země jako USA nebo Nizozemsko z toho poučit?" od

Tomase Pueyo z 9. 6. Celé zde:

https://medium.com/@tomaspueyo/coronavirus-should-we-aim-for-herd-immunity-like-sweden-b1de3348e88b

Tento obsáhlý analytický materiál jsem vybral a zařadil do seriálu nikoli proto, že je určitou kritikou "švédské cesty" a dokumentuje škody, které koronavirus napáchal, ale zejména proto že logika průběhu epidemií v různých zemích dává představu o logice chování našeho viru a bezprostředně souvisí s tím, jakou evolučně stabilní strategii náš virus má. Materiál odlišuji fialovou barvou:

(Pokračování)

Jaký byl tedy švédský oficiální postoj v tom všem? 30. dubna zveřejnila země výsledky testu, který zjistil, že 2,5 % Švédů bylo infikováno do 3. dubna. Oficiální švédský model předpokládal, že 26 % populace bude infikováno o měsíc později, do 1. května.

Johan Giesecke, poradce vlády a bývalý hlavní epidemiolog země, si myslel, že při hromadném testování by bylo 50 % infikovaných. Tom Britton, klíčový "modelář" pro tuto zemi, souhlasil. To by byla dobrá zpráva: Bylo by dokázáno, že přístup založení na stádní imunitě funguje.
Co se vlastně stalo? Dne 20. května země zveřejnila aktualizaci průzkumu. Namísto infikování 26 % populace to bylo jen 5,4% (ve Stockholmu 7,3 %. Národní průměr 5,4 %, zjistil se překročení podle věku).
Tato čísla pravděpodobně odráží imunitu kolem 20. dubna, protože to trvá nějakou dobu, než se vytvoří protilátky. Asi polovina z 5,4 % je však pravděpodobně falešně pozitivních. Je možné, že skutečná pozitiva do 20. dubna byla pouze 2,3 %. Bez ohledu na to, buďme velmi velkorysí a předpokládejme, že do konce dubna byla 7 %.
To bylo kritické: švédští epidemiologové se domnívali, že oběti v zemi je mohou dostat na cestu ke stádní imunitě. Ukázalo se, že se ušlo jen 10 % cesty, a že počet obětí se bude muset znásobit až 10krát, než se dostaneme ke stádní imunitě. Nebo více, protože starší lidé byli méně infikováni než zbytek populace (2,7% u lidí starších 65 let).
"To znamená buď to, že statistické výpočty Úřadu pro veřejné zdraví a mně jsou docela špatně. [...] Nebo je to větší část, která byla infikována, než ta u které se vyvinula protilátka." - Tom Britton, profesor matematiky na Stockholmské univerzitě a poradce švédské vlády, prostřednictvím Dagens Nyheter.
Při 10 milionech Švédů, 7 % znamená, že asi 700 tisíc bylo infikováno v určitém okamžiku, a přibližně devětkrát více by muselo být infikováno, aby bylo dosaženo stádní imunity. Protože úmrtí trvá přibližně 3 týdny, mělo by to být srovnatelné s počtem úmrtí na konci května, tedy kolem 4000.
Při infikovaných 700 000 a  4 000 úmrtích by míra úmrtnosti na infekce (IFR) byla 0,57 %. Švédská vláda si myslela, že by to bylo 0,1%, což je téměř šestkrát nižší, než je tomu v současnosti.
"Myslím, že [míra úmrtnosti] bude jako těžká chřipková sezóna, která by mohla být v řádu asi 0,1%." Johan Giesecke, poradce švédské vlády a bývalý šéf oddělení nyní v čele s Tegnellem, přes Unherd.
Pokud by virus prošel celou populací, tak by se počet úmrtí násobil řádově, čímž by se počet obětí zvýšil na 30 000–40 000 lidí.
Mimochodem, toto není pro Švédsko specifické. I v oblastech s masivními ohnisky bylo infikováno nízké procento populace.

Nejen to, ale má to také zásadní předpoklad: že lidé s protilátkami proti koronaviru jsou ve skutečnosti imunní. Ale to nevíme.
Mohlo by se například stát, že se zdá, že někteří lidé mají imunitu, ale ve skutečnosti mají protilátky proti jinému typu koronaviru. Mohli si také vyvinout několik protilátek z malé expozice viru, ale větší expozice by mohla přemoci jejich systém. Pokud by takové situace byly nastaly, v zemi, jako je Švédsko, by mohlo být procento populace, která je v současné době imunní, dokonce nižší než 6,7 % a dosažení odolnosti vůči stádu by mohlo být ještě dále.

(Pokračování)

Co se děje ve světě:

Zde je nejlepší zdroj s nejčerstvějšími informacemi:

https://www.worldometers.info/coronavirus/#countries

Další významné zdroje o dění ve světě:

https://www.ft.com/content/a26fbf7e-48f8-11ea-aeb3-955839e06441

https://ourworldindata.org/coronavirus

První z odkazů přebírá Financial Times. Je na něm mj. vyjádřeno i to, jak vzrostl počet úmrtí v jednotlivých zemích oproti tříletému průměru. Na to by se měli podívat všichni popírači a chřipkaři.

Graf šíření mutuací:

https://nextstrain.org/ncov/global?gmax=19896&gmin=15114

Tyto stránky ukončily uveřejňování nových příspěvků, ale archiv zůstal. Důležitý je závěr, ke kterému dospěly.

Podrobněji lze vývoj v ČR sledovat zde:

https://onemocneni-aktualne.mzcr.cz/covid-19?fbclid=IwAR3kdxZhYD7krsZ_K-xrmwNkGlQMO5rsIjQe_0jAWZT___jH_9pV_KzA38c

Nejdůležitější je tento graf:


Na závěr: Děkuji všem, kteří mi zasláním materiálů a doporučeními pomáhají. Rád uvedu jména, pokud dají souhlas.
(Pokračování)