COVI-kávička : ČR +197 US +53253. Komentář
Česká republika: +197 nových případů (sice pod dvě stě, ale soborní výsledek).
Spojené státy: +53253 nových případů (méně dramatický nárůst, ale k tomu přes tisíc mrtvých).
Problémy: Indie přes 60 tisíc nárůst denně, Kolumbie přes 11 tisíc.
Pokud srovnáváme jednotlivé země mezi sebou, je nutné uvažovat různou metodiku a další faktory, které výsledek ovlivňují (např. počet testů). K tomu se postupně dostanu. Důležité je však právě průběžně sledování, protože z časových řad lze vyčíst hodně i při odlišných metodikách.
Informace čerpám zejména z: https://www.worldometers.info/coronavirus/#countries
Jak to vidím
Zajímavý článek o původu našeho viru:
Bylo uveřejněno na Novinkách, zpracováno podle důvěryhodných odborných zdrojů (odlišeno barvou a zvýrazněno tučně, klíčové místu i zvýrazňovačem):
Šest havířů onemocnělo neznámou respirační chorobou na jaře 2012. Tři z nich zemřeli. Nákazu u nich zkoumali i experti z virologického ústavu ve Wu-chanu z oddělení vedeného přední viroložkou Š´Čeng-li, protože právě u netopýrů z jeskyní v provincii Jü-nan byl zjištěn původce jiné plicní koronavirové choroby SARS.
Šest havířů bylo přijalo První lékařskou fakultou na univerzitě v Kun-mingu na přelomu dubna a května 2012. Léčeni byli s nespecifickou plicní infekcí. Příznaky měli podobné jako má covid-19, tedy dýchací obtíže, suchý kašel, stoupající množství hlenů a vysokou teplotu, kterou měli před smrtí.
Čtyři měli také nízkou hladiny nasycení hemoglobinu kyslíkem, což je také typický příznak vážného průběhu covidu-19. Jen u jednoho z nich se potvrdila i jiná virová nemoc, byl pozitivní na žloutenku a EBV. Tři pacienti byli na plicní ventilaci, všichni dostávali steroidy a pět z nich antivirotika.
Horníci onemocněli, když odstraňovali v dole Mo-ťiang netopýří trus.
Studie kunmingské fakulty v časopisu Master´s Thesis z května 2013 informovala o analýze šesti nemocných s vážnou pneumonií způsobenou neznámým virem. O rok později psal časopis Science už o možné existenci nového viru v Číně, který zabíjí, i když v něm byl zmiňován jiný virus zjištěný u krys v dole.
Vzorky viru byly poslány do virové laboratoře ve Wu-chanu, který je vzdálen asi 2000 km. Tam je zkoumali s cílem zjistit, zda u nich nehrozí nebezpečí, že by virus mohl vyvolat pandemii.
Dostal je i plicní expert Čong Nan-šan, který pomohl zvládnout epidemii SARS, protože panovalo podezření na nemoc vyvolanou betakoronaviry, kam patří původci covidu-19, SARS i MERS.
Analýza ukázal, že u horníků byla zjištěna přítomnost sekvenci RNA netopýřího koronaviru označenou jako BtCoV/4491 a (později označovaného jako RaTG13). Ta má genetickou strukturu velmi podobnou RNA koronaviru SARS-CoV-2, který je původcem covidu-19. Shoduje se v 96,2 procenty (respektive 98,7 procenty).
Sekvence netopýří RNA BtCoV/4991 byla popsána v roce 2016. RaTG13 je pak kompletní genová sekvence zmíněného netopýřího koronaviru.
Přední čínská viroložka S´Čeng-li, která vede laboratoř ve Wu-chanu, potvrdila, že obě analyzované sekvence pocházejí z výkalů netopýrů druhu Rhinolophus sinicus patřících do rodu vrápenců.
Genetická informace RaTG13 se shoduje s RNA původce covidu-19 SARS-CoV-2 v 96,2 procentech. Neliší se ani v té části genomu, která odpovídá za to, na jaký protein se koronavirus navazuje. Latham a Wilsonová připomněli, čím se původce covidu-19 liší – reaguje na enzym furin, což mu umožňuje se rychleji šířit v těle napadeného, když se napojuje na buňky mající receptor ACE2.
Sami odmítli spekulovat, zda k této mutaci viru došlo přirozeně, v těle napadených horníků, či genetickou manipulací v nějaké laboratoři, i Latham o tom dříve spekuloval.
Oba přiznávají, že RNA obou koronavirů se liší v 3,8 procentech, což je asi 1200 nukleotidů. Podle evolučního virologa Edwarda Holmese by takováto změna trvala 20 až 50 let, oni ale namítají, že mutace jsou rychlé zejména na počátku oddělení nového kmene a pak se zpomalují.
Navíc malý počet mutací u SARS-CoV-2 naznačuje, že koronavirus způsobující covid-19 už musel nějakou dobu kolovat mezi lidmi a ustálit svůj genom. Podle Latham a Wilsonové mohl být mezi horníky hledaný pacient nula, který stál na počátku epidemie. Podle nich by to mohl být jeden z přeživších a spekulují zejména o muži, jemuž byl odebrán brzlík, kde bývá hodně virů.
Zdůraznili však klíčovou roli, kterou mohl mít jeden ze dvou wuchanských virologických institutů při šíření viru. Podle nich z laboratoře virus unikl v roce 2019 a dostal se na místní tržnici. Mohlo jít o neopatrnost personálu při manipulaci.
Podobné nehody nejsou neobvyklé, v roce 1967 se v laboratoři v německém Marburgu nakazilo novým neznámým virem 25 zaměstnanců a šest dalších lidí včetně lékaře a patologa. Virus pocházel od opic dovezených na pokusy z Ugandy. Latham uvedl i další příklady.
Oba upozornili na podivnou změnu pohledu čínské viroložky Š´Čeng-li, která při šetření v roce 2012 uvedla, že horníci zemřeli na koronavirovou infekci, ovšem v březnu 2020 už tvrdila, že zemřeli na plicní plísňovou infekci.
Spekulace, že by virus unikl, odmítá Š´Čeng-li s tím, že v institutu neměli k dispozici živý virus RaTG13. V institutu však dělali pokus živými netopýřími koronaviry, loni v dubnu o podobných pokusech s netopýřími alfakoronaviry informovali ve zprávě na virologickém webu mdpi.
K tomu ode mne:
Článek, který vychází ze seriózních zdrojů, nastoluje řadu otázek:
- Když nemoc propukla, jak to, že se nerozšířila už po roce 2012, když na to měla dost času?
- Jak si vysvětlit tak velký posun v mutacích? (Toho nelze tak snadno dosáhnout ani umělou cestou.)
- Jak to, že nyní je náš virus tak stabilní (setkáváme se jen s oscilujícími mutacemi)?
Podle mě to vše nasvědčuje tomu, že:
- Základní kmen našeho viru (Covid-19) se replikoval v lidském prostředí od pradávna, převzal a upravil si na lidské podmínky svou evolučně stabilní strategii "šetrného chování", a to včetně všech tří složek. (Viz odkaz dále.)
- Pak došlo ke vzniku mutací (spontánně či uměle), které odblokovaly některé brzdy (patrně skutečně více brzd) šetrného chování, ale ty, které se objevily v roce 2012, byly velmi rychle vytlačeny základním kmenem s použitím obranné a stabilizační složky evolučně stabilní strategie. Proto se virus dále nešířil.
- V masivní zdivočelé formě (portfoliu mutací či modů) se projevil teprve v důsledku proniknutí základního kmene do masivních migračních toků (cestování Číňanů za prací do Itálie a dalších zemí), setkání různých mutací a přežívání excitovaného modu v důsledku šíření vícenákaz v měřítku, na které se náš virus neměl možnost ve svém vývoji dostatečně připravit.
Zda tomu tak bylo či ne, je důležité. Kromě jiného i z hlediska toho, nakolik efektivní může být manuál Jiřího Bureše, kterému se chci věnovat zítra (doufám, že už mně do toho nic nevleze a nic se nepokazí). Zde je odkaz na zmíněný manuál:
Pro ty, kteří ještě nečtli nic o evolučně stabilní strategii, zde:
https://radimvalencik.pise.cz/8226-evolucne-stabilni-strategie-cloveka-a-koronaviru.html
Co se děje ve světě:
Zde je nejlepší zdroj s nejčerstvějšími informacemi:
https://www.worldometers.info/coronavirus/#countries
Další významné zdroje o dění ve světě:
https://www.ft.com/content/a26fbf7e-48f8-11ea-aeb3-955839e06441
https://ourworldindata.org/coronavirus
První z odkazů přebírá Financial Times. Je na něm mj. vyjádřeno i to, jak vzrostl počet úmrtí v jednotlivých zemích oproti tříletému průměru. Na to by se měli podívat všichni popírači a chřipkaři.
Graf šíření mutuací:
https://nextstrain.org/ncov/global?gmax=19896&gmin=15114
Tyto stránky ukončily uveřejňování nových příspěvků, ale archiv zůstal. Důležitý je závěr, ke kterému dospěly.
Podrobněji lze vývoj v ČR sledovat zde:
Nejdůležitější je tento graf:
Na závěr: Děkuji všem, kteří mi zasláním materiálů a doporučeními pomáhají. Rád uvedu jména, pokud dají souhlas.
(Pokračování)